Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms