Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gins2Q9D600 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gins2Q9D600 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms