Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7Q9D541 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ccdc7Q9D541 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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