Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms