Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms