Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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