Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CYI0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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