Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Snx7Q9CY18 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx7Q9CY18 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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