Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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