Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms