Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms