Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms