Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms