Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms