Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms