Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms