Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms