Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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