Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms