Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwa5aQ99KC8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwa5aQ99KC8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwa5aQ99KC8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwa5aQ99KC8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwa5aQ99KC8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms