Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP9Q99956 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms