Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim59Q922Y2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms