Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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