Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps36Q91XD6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms