Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Smg8Q8VE18 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smg8Q8VE18 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smg8Q8VE18 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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