Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms