Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms