Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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