Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms