Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2f4Q8R0K9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms