Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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