Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prpf39Q8K2Z2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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