Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms