Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rp1l1Q8CGM2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rp1l1Q8CGM2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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