Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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