Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms