Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nhlrc3Q8CCH2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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