Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cacnb2Q8CC27 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cacnb2Q8CC27 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cacnb2Q8CC27 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cacnb2Q8CC27 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cacnb2Q8CC27 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms