Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nrip1Q8CBD1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms