Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms