Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc9b1Q8C0X2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc9b1Q8C0X2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc9b1Q8C0X2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc9b1Q8C0X2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc9b1Q8C0X2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9b1Q8C0X2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc9b1Q8C0X2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9b1Q8C0X2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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