Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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