Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp4aQ8BU40 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp4aQ8BU40 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms