Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms