Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms