Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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