Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130040H23RikQ8BII3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms