Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms