Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Atg4bQ8BGE6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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