Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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